LINUX peut lire et écrire sur les systèmes de fichiers de ces OS. Dans le cas du système de fichiers NTFS de Windows XP, il faut néanmoins utiliser un noyau 2.6 pour réaliser des opérations d'écriture. Par ailleurs, LINUX supporte les systèmes de fichiers d'autres UNIX, d'Amiga et d'OS/2.